mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GGGCTCCTTATAGTTCAAACG TAGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCGGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATACCATAAGCCCTAATCCTTGTATTGAAAAAGGACTTGGTAATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTACCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 1 0 3' arm Raphanus_raphanistrum_subsp__raphanistrum micropc MIR159 2e-59 bra-MIR159a 1e-75 -71.4 (((((((((((.(((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((...((...(((((.........)))))...))...)))))..).)))).)).)).))))))...)))))))......)))...)))))).))))))))).))))))))))) (-71.40)