mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTAAAGTTCAAACG GAGCTCCTTAAAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAACCTTAAACATAGAAAAAGGATTTTGGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTC 2 0 3' arm Brassica_napus micropc MIR159 3e-64 aly-MIR159a 1e-72 -67.9 (((((((((..((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((((((..((((((...........)))).))..)))).)))))..).)))).)).)).))))))...)))))))......)))...)))))).))))))))..))))))))) (-67.90)