mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATCCCTTATATTATGGGACG TCCCACAATATAAGGAATTTT CGTCCCACAATATAAGGAATTTTGATTTTTTGTTTGTAACGTTTGACCACTCGCCTTATTTAAAATTTTAAATAAGATGAGTGGTCAAACGTTACAAACAAAAACTTAAAATCCCTTATATTATGGGACG 2 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR1122 4e-66 osa-MIR818e 5e-19 -77.3 (((((((.(((((((((.(((((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((((((....))))))))).))))))))))))))))))))))))))).))))))).))))))))).))))))) (-77.30)