mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCT GGCTCCTTGAAGTCCAATAGA AGGGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGTTCTTGCTGGGTAGATTAAGCTGCTAAGCTATGGATCCACAGCCCTATCTATCAACTGAAGGATAGGTTTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTGCCTAATGTTAGATCCCTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 2 1 3' arm Populus_deltoides micropc MIR159 6e-81 ptc-MIR159a 1e-84 -69.3 ((((((((((..(((((((.(((((.(((.(((((((((...(((((.((.((.((((.(.((.(((.(((((((.((....)).))))))).))).))..).)))).)).)).)))))..)))))))..)).)))..))))))))))))..)))))))))) (-69.30)