mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACT CTCAAGAAAGCTGTGGGA TTCCACAGCTTTCTTGAACTTCTTTGCCTTGCTTAATCTGTGTATATATAGATCACTACATGTACAGCTCCTATATATATAAATATATGTATGTATAGCGCCATGGAAGCTCAAGAAAGCTGTGGGA 1 0 5' arm Populus_trichocarpa_x_Populus_deltoides micropc MIR396 3e-33 ptc-MIR396e 1e-34 -50.4 (((((((((((((((((.(((((..((.............(((((((.(((....))).)))))))....(((((((((((......))))))))))).))...))))).))))))))))))))))) (-50.40)