mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCCAAAGGAGAATTGCCCTG GGGTATATCTCCTTTGGCAC CAGGGTATATCTCCTTTGGCACGGAGGCACGCAACCATCCGTAGGTATGTTAATGGATGGTGGCAAGCTGCTGGCTTGGAAGATGCAGCATAATAGCCGTGCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCTG 2 0 3' arm Panicum_virgatum micropc mir-399 0.0000004 tae-MIR399 0.000000006 -69.2 (((((((..((((((((((((((.((((..((.(((((((((..........))))))))).))..(((((...((....))..)))))......))).).))))))))))))))..))))))) (-69.20)