mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGATTGAAGAGAGCTC GCTTTCTTCAGTCCAACGA GAGCTTTCTTCAGTCCAACGAAAGGCCGTATAGGGATGATTCAACTGCTGGTTCATGGACTCTACTATCTTGTAATCCTCGAGGTTCAGTATTGGCGGCAAGATAATGGTGTGCATGACACGGGAGTCGTATTGCCACTACGCTGTTTTTACTTGGATTGAAGAGAGCTC 1 0 3' arm Pinus_taeda micropc 100 pta-MIR159b 2e-93 -70.66 ((((((((((((((((((..((((((.(..(((((.((((.(.(((.(((..(((((.((.(((.((((((((...((...............))..)))))))).))).)).)))))..))).))).).)))))).)))..).))))))..)))))))))))))))))) (-70.66)