mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGACTGAAGGGAGCTCC AGCTTTCTTCAGTCCAAACA GAGCTTTCTTCAGTCCAAACATGGGTGGCAGTAGGATTCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATGCTGAGATGAGATGACGATGAACCCGGCCTTGATGACTAATGAACACTGTCTCAGTAACTGAGTGAATGATGCGGGAGACAAGTTGGATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCC 4 0 3' arm Ipomoea_nil micropc MIR159 1e-26 rco-MIR319a 8e-28 -85.2 (((((..(((((((((((..(((((.(((..((((((((((((.(((((((..(((((((..((..(((((((((.((....((.......))...((.((.....)).))..)))))))))))..))..)))))))..)))))).).)))))))))))).))).)))))..)))))))))))..))))). (-85.20)