mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTGTCTCAAACTTGCTGCC CAGCCAGTTTGAGATAACAAT GGCAGCCAGTTTGAGATAACAATTGTGTATTTTGCAAAGAATTGATTGCTCAACTCCATGGGAGGCTGTAGTGCCAAATGTGATGTATTCTAACTGTTGTCTCAAACTTGCTGCC 1 0 3' arm Allium_cepa micropc 100 100 -44.3 ((((((.((((((((((((((.(((.((((.(..((..((.((((....)))).)).......(((......)))...))..).))))..))).)))))))))))))).)))))) (-44.30)