mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAATA TGGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAAGCTCCTGCTGGGTAGATCGAGCTGCTGAGCTATGAATCCCACAGCCCTATCACCATCAGTCATTTTGATGGGCCTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTACCTAATGTTAGATCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 2 0 3' arm Populus_nigra micropc MIR159 1e-76 ptc-MIR159b 8e-80 -74.32 (((((((((((..(((((((.(((((.((..(((((((((...(((((.(((((.((((....((.(((.(((((((.............))))))).))).))....)))).))))).)))))..)))))))..))..)).))))).)))))))..))))))))))) (-74.32)