mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCT AGCTCCTTAAAGTTCAAAC AGAGCTCCTTAAAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAACCTTAAACATAGAAAAAGGATTTTGGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCT 2 0 3' arm Brassica_napus micropc MIR159 2e-65 aly-MIR159a 8e-74 -69.5 ((((((((((..((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((((((..((((((...........)))).))..)))).)))))..).)))).)).)).))))))...)))))))......)))...)))))).))))))))..)))))))))) (-69.50)