mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTAAAGTTCAAACG TAGAGCTCCTTAAAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAACCTTAAACATAGAAAAAGGATTTTGGTTATATGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATGGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 2 0 3' arm Brassica_napus micropc MIR159 1e-66 aly-MIR159a 5e-75 -70.8 (((((((((((..((((((((.((((((..((((((((((...((((((.((.((.((((.(..(((((((((..((((((...........)))).))..)))).)))))..).)))).)).)).))))))...)))))))......)))...)))))).))))))))..))))))))))) (-70.80)