mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCC GAGCTTTCTTCAGTCCAAAC GAGAGCTTTCTTCAGTCCAAACATGGGTGGCAGTAGGATTCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATGCTGAGATGAGATGACGATGAACCCGGCCTTGATGACTAATGAACACTGTCTCAGTAACTGAGTGAATGATGCGGGAGACAAGTTGGATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCC 4 0 3' arm Ipomoea_nil micropc MIR159 4e-27 rco-MIR319a 2e-28 -85.4 ..(((((..(((((((((((..(((((.(((..((((((((((((.(((((((..(((((((..((..(((((((((.((....((.......))...((.((.....)).))..)))))))))))..))..)))))))..)))))).).)))))))))))).))).)))))..)))))))))))..))))).. (-85.40)