mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGA TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCACCTATTAGATTTATGTTGATGTTGTTGTGCGATTTGCCATGACCATATGACATTGTATTCATTTTTGCTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGA 1 0 5' arm Populus_tremula_x_Populus_tremuloides micropc MIR396 3e-54 ptc-MIR396b 2e-55 -41.1 ((((((((((((.((((((((((.(.....((...(((((.((((.((..((.(.....)))..)).))))))))).....))......).)))))))))).)))))))))))) (-41.10)