mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTGAAGTCCAAAA GAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGTTCTAGCAAGGGTAAATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGTCCTATGTATCAGATTTTAGGGTTTGTTTCTGATGATGGTGATGATAGGCTTGTGGCTTGCATATTTCTGGAGCTTCATTACCCCTTAAGTTTTACCCTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTC 2 0 3' arm Citrus_sinensis micropc MIR159 8e-16 csi-MIR159 3e-92 -78.5 (((((((((..(((((((((((((....((((((((..(((.(((((.(.(((.((((.(..((((((.(((((.(((((....((((((.....))))))...)))))...))))).))))))..).)))).))).).))))).)))..)))))..)))....)))))))))))))..))))))))) (-78.50)