mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACCACTGAAATTATTGTTCG AACAATAATTTCAGTGGAA TACCACTGAAATTATTGTTCGAAATAACACCTGCAATTCATGGATGTATACTGCCGTGGTATCGCCAGTCTAACCTAGTTGCAGGGTTGCAACACATGGCATGGTGGGGGATCTATTGGGCAATAACCAAGTTGCATGGGTGTATTTATCCAACAATAATTTCAGTGGAA 4 0 5' arm Pinus_taeda micropc 100 pta-MIR1313 2e-65 -63.4 ..(((((((((((((((((..(((((.(((((((((((..(((.(((....((((((((.(((.((..((...((..(((((......)))))....))...))..)).)))))))..))))))).)))))))))..))))))))))....))))))))))))))))).. (-63.40)