mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATGCACTGCCTCTTCCCTGGC CGGGGAACAGGCAGAGCATGG GACGGGGAACAGGCAGAGCATGGATGGAGCTACTAACAGAAGTACTTGTTTTGGCTCTACCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGC 4 0 3' arm Populus_nigra micropc MIR408 1e-40 ptc-MIR408 6e-42 -49.2 ..(((((((.((((((.((((((.((((((((..(((((......))))).)))))))).)))))).)))))).))))))).. (-49.20)