mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGAGAGCTCCC GAGCTTTCTTCAGTCCAACG GGGAGCTTTCTTCAGTCCAACGAAAGGCCGTATAGGGATGATTCAACTGCTGGTTCATGGACTCTACTATCTTGTAATCCTCGAGGTTCAGTATTGGCGGCAAGATAATGGTGTGCATGACACGGGAGTCGTATTGCCACTACGCTGTTTTTACTTGGATTGAAGAGAGCTCCC 0 0 3' arm Pinus_taeda micropc 100 pta-MIR159b 7e-96 -77.26 ((((((((((((((((((((..((((((.(..(((((.((((.(.(((.(((..(((((.((.(((.((((((((...((...............))..)))))))).))).)).)))))..))).))).).)))))).)))..).))))))..)))))))))))))))))))) (-77.26)