mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATTGAGCCGCGCCAATAT GTTGGTGAGGTTCAATCCG ATGTTGGTGAGGTTCAATCCGAAGACGGATTTACGAATTGATTCAGTCGTAAAATACGATCTCAGATTGAGCCGCGCCAATAT 1 0 3' arm Gossypium_hirsutum micropc MIR171_1 3e-22 tcc-MIR171c 9e-35 -34.9 (((((((((.(((((((((.((.((((..(((((((.(((...))))))))))...)).)))).))))))))).))))))))) (-34.90)