mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT GGAGCTTTCTTCGGTCCACTC AGGGAGCTTTCTTCGGTCCACTCATAGAATAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATATGTAGACATATGGTAAATGAATGAATGATGCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT 3 0 3' arm Brassica_napus micropc MIR159 1e-72 ath-MIR319b 8e-74 -75.24 ((((((((..((((((((((..((((((.......(((((((((((((..((((.(..((((((((.((..(((((.(((..............))).)))))..)).))))))))..).))))...))))))))).))))...))))))..))))))))))..)))))))) (-75.24)