mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGGGTGAAGGGAGCTCC AGCTCTCTATCGCCTCGACC GGAGCTCTCTATCGCCTCGACCCTGAAAGGAAATCGATCATGGTGGTTCATGGCTGCTCTTTCATGAATGCTTGTAGGTGCACCAATGTTGTTGTAGTGTGCATTCTAAGGTTAGCATGAAGGTGGAGCCATGGTTTGATCATCTTTTTGGGATTGGGGTGAAGGGAGCTCC 0 1 3' arm Lactuca_sativa micropc MIR159 0.0002 ptc-MIR159e 0.000009 -83.1 ((((((((((.(((((((((.((..((((((....(((((.......((((((((.(.((((((((...((((.((((((((((.((......)).).))))).))))))))...)))))))).).))))))))..))))).))))))..)).))))))))))))))))))) (-83.10)