mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTGGTTCAAGG GGAATGTTGTCTGGTTCAAGGTCTTGCTTTCCGATTTGAGGATGATCCATGCTTGCATGTGTAGTTTTTTTTGTTCCTCAGATCTACAAGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC 3 0 3' arm Zea_mays micropc mir-166 4e-41 zma-MIR166b 1e-43 -47.64 ((((((..(((((((((.((((((((......((((((((((..(..((((....))))..)............))))))))))..)))))))).)))))))))..)))))) (-47.64)