mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCGTCACGTGACGCCTGGGC CCAGGCCTCATCAGGGCGTCTA AGGAACCAGCCAACAAATGTAGGCGTCACGTGACGCCTGGGCTTTGTGATTAGGGGACATGGGTTTACCCATGCCCTCACGGTGGCGAGGAATATCATGCCCTTGGCACGATTGCCCTCTGTCTCCTTAATCACGCCCCAGGCCTCATCAGGGCGTCTATATTTCATTTTATTTTAT TGCTCCCTGACATTGACAATGACATTCGCATGAAGCTAAGACCGGATATTCTCAGAATTAGAGGGCTACCAGCAGGCGCAACGAACTTTGCGATTTCAAAGGACCAACGGGCGCGATATGAAGTACAGATTATCGAGGTTGGCTATTGTGCGGACACAAGATACAAAGAGAAAATGCAAGCTAAATTGTCACAACATGCACAGCTTGTGCAATACTTGCGCGACGCAGGGTGGAGGGTGCAAGACCCTTACGTATTTCTGTTTGGGGTTGCTGGCACTATTTAAAAACGGATTTGACACAGTTGCAAACAACTAGGTGTATCATCAAGCAACGCCAAAAAGACATCCACAAAGATTCATATTAATTCCGTGCAATGGGTGGACAAACTCGTGAAGACTCGACGCCACTTCTCAAGGAACCAGCCAACAAATGTAGGCGTCACGTGACGCCTGGGCTTTGTGATTAGGGGACATGGGTTTACCCATGCCCTCACGGTGGCGAGGAATATCATGCCCTTGGCACGATTGCCCTCTGTCTCCTTAATCACGCCCCAGGCCTCATCAGGGCGTCTATATTTCATTTTATTTTATTTTATGGGCATGTGCTAGCACAAATGAAAAAAAGGGGCTGACTCTAAAGGGGCTGCCCATGAAACCGGCAAATCACCTGCTGGGAGAAGTTCTGGTTGATGGCGGTGGCCTCCAGGGAGAGCTGCTGCATGCCGTTGATGTTGTCCTTGTCCTCGGGTATGGCCTCGGGGGACGTCTCAGCCACAATCAGCATGTCCAGGGACGAGCAGTTGCGCTTTAGGAATCTGGCAGCCTTCAAGGCATGAAGTTCACATGCAGCTTGTTTGCAGACGCACCTTGCCTTCGGCAG 4 1 5' arm Coccomyxa_sp._C-169 mirnest 100 100 -70.3 .((......))...(((((((((((((..((((.(((((((...((((((((((((((.((((....)))).(((((...)).)))((((...(((.((((...)))).)))...)))).))).))))))))))).))))))).))))...)))))))))))))............. (-70.3)