mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAGCCAAGGATGACTTGCCGG GGCAAGTCTGTCCTTGGCT CAGCCAAGGATGACTTGCCGGCTCCTGGTATTGGGGGAATCTCAGCTTTGCTGAAGCGCCTTGGAGTTAGCCGGCAAGTCTGTCCTTGGCT 1 1 5' arm Oryza_sativa micropc MIR169_2 2e-45 osa-MIR169c 1e-46 -51.2 .((((((((((((((((((((((.......((.((((....(((((...)))))....)))).))...)))))))))))).)))))))))) (-51.20)