mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGACTGAAGGGAGCTC GCTTTCTTCGGTCCACTCA GAGCTTTCTTCGGTCCACTCATAGAATAATATGTGAGATTTAATTGACTCTCGACTCATTCATCCAAATACCAAATGAAAGAATATGTAGACATATGGTAAATGAATGAATGATGCTAGAGACAAATTGAATCTTCACTTCTCTATGCTTGGACTGAAGGGAGCTC 4 0 3' arm Brassica_napus micropc MIR159 9e-71 ath-MIR319b 5e-72 -67.04 (((((..((((((((((..((((((.......(((((((((((((..((((.(..((((((((.((..(((((.(((..............))).)))))..)).))))))))..).))))...))))))))).))))...))))))..))))))))))..))))) (-67.04)