mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCTTGTAACGTTTGACCAC GATCAAACGTTACATGTAAAA TCTCAATAAGGGCTGTGATCATGTACTCCCTCCGTATCATAATATAAGGGATTTTAAGTTTTTGCTTGTAACGTTTGACCACTCGTCTTATTCAAATTTTTTTGAAATTATTAATTATTTTATTTGTGACTTACTTTATTATCTAAAATACTTTAAGCATAACTTTTCATTTTTTATATTTGCAAAAAAAATTTGAATAAGACTAGTGATCAAACGTTACATGTAAAAAATCAAAATACCTTATATTGTGGGACAGAGGGAGTAGATATTTAGGTCCTTCATGACA TTCGGCATTCATGTCTCTTCGACATCGATTCAGATCTTGTTCTCGCAAATCGCGATCGCCAACGGTCAGTTGGAGAAGTTCTACCAGCCAAGGTCAAGCCATCATGTCGCCTCGGCGATCGTTCATGGCGAGAAGATCCCTCTCTATGGAGCTGGAGAAACATTCGCCTTGTCGAATGCTGGAGGTGCTGTGCCACTGACTCTAGACTTGGTGGTAAGAGCTAGAGGGTATGTGATTGGTAAGCTTGTGAGGGTGACACACACAAAGCGTGTGAAATGCCCGGTGGTTATCGATTCCGGTAGCTCCAAGCCGATTAGGTTTATCCAGAGTGCTTGTAGTTACACCTGATGCAGTGCCTTGGCCTTCTATAATCTCAATAAGGGCTGTGATCATGTACTCCCTCCGTATCATAATATAAGGGATTTTAAGTTTTTGCTTGTAACGTTTGACCACTCGTCTTATTCAAATTTTTTTGAAATTATTAATTATTTTATTTGTGACTTACTTTATTATCTAAAATACTTTAAGCATAACTTTTCATTTTTTATATTTGCAAAAAAAATTTGAATAAGACTAGTGATCAAACGTTACATGTAAAAAATCAAAATACCTTATATTGTGGGACAGAGGGAGTAGATATTTAGGTCCTTCATGACATGAGCAAACAAGAAAATAAGCAGTAGTTTTATCTTCCAATTTTGCCATGTTGATATCTCTTGCTAACATATTGTGATGTCGTTTTATCAGTGTTACATGTCATTGCGCTTTGCGACAAGTTTTTATACACTAATTTAGAAGTTGGTTTTAAACAATATCCTCTGTTAGTTTCATAGATCGATGAAATGGTTCAGAAAGAAATTGAAGGTGGAAAAAAAGAAGTTATCTCCTGAACAGAGTTTCATTCTAATTCTACATCTTCAAAGTTTTTC 2 0 5' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 2e-69 osa-MIR818e 5e-21 -94.3 ..(((..(((((((..(((.((.(((((((((.((.(((((((((((((.(((((...(((((((.((((((((((((.((((.(((((((((((((((((((..((.(((.((.........(((((.((((...((((......))))...)))))))))..........)).))).))...))))))))))))))))))).)))).)))))))))))).)))))))...))))).))))))))))))).)).))))))))).)))))..)))))))..))).. (-94.3)