mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACAGAAGATAGAGAGCAC GCTCTCTATACTTCTGTCAA TTGACAGAAGATAGAGAGCACTAAGGATGACATGCAAGTACATACATATATATCATCACACCGCAAGTGGATATAAGGAAATTCAAGAAAGAGAGGAAAAAAGAGCCTGCATCTCTACTCTTTTGTGCTCTCTATACTTCTGTCAA 1 1 5' arm Brassica_rapa micropc 100 bna-MIR156c 3e-36 -50.4 .((((((((((((((((((((.(((((.((.(((((.((.(.......((((((..(((.......)))))))))......(((......))).........).)).))))).))...))))).))))))))))).))))))))). (-50.40)