mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTTAAGTTCAAAC GAGCTCCTTTAAGTTCAAACGAGAGTTTAGTAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGGATCCCATAAGCCCTAATCCTTATAGAGAGAAAAAAAAGGATTTGGTTATATGGCTTGCATATCTTAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTC 1 0 3' arm Brassica_rapa micropc MIR159 5e-54 aly-MIR159a 1e-66 -75.24 ((((((((((.((((((((.((((((..((((((((((...((((((.(((((.((((.(..(((((((((..(((((((..............))))))).)))).)))))..).)))).))))).))))))...)))))))......)))...)))))).)))))))).)))))))))) (-75.24)