mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGATTGAAGAGAGCTCC AGCTTTCTTCAGTCCAACGA GGAGCTTTCTTCAGTCCAACGAAAGGCCGTATAGGGATGATTCAACTGCTGGTTCATGGACTCTACTATCTTGTAATCCTCGAGGTTCAGTATTGGCGGCAAGATAATGGTGTGCATGACACGGGAGTCGTATTGCCACTACGCTGTTTTTACTTGGATTGAAGAGAGCTCC 1 0 3' arm Pinus_taeda micropc 100 pta-MIR159b 1e-94 -73.96 (((((((((((((((((((..((((((.(..(((((.((((.(.(((.(((..(((((.((.(((.((((((((...((...............))..)))))))).))).)).)))))..))).))).).)))))).)))..).))))))..))))))))))))))))))) (-73.96)