mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGGACCAGGCTTCATTCCC GAATGTTGTCTGGACCGGG GGGAATGTTGTCTGGACCGGGGACACTTGTGTTTCTAATCCGTTTTCCCTGCAATATTGTTCTGATTAACGTGGGGATCTTTATATTGCTTATTTTTGTAATGGATTAAGGTTGTACTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCC 3 0 3' arm Gossypium_hirsutum micropc mir-166 0.0000001 ghr-MIR166b 1e-78 -58.19 (((((((..((((((.((((.((((((.(((.(..(((((((((......(((((((.(((((.((....)).)))))....)))))))..........)))))))))..)...))).)))))).)))).))))))..))))))) (-58.19)