mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGGGGCATGCAGAGGAG CCTGTGCTTGCCTCTTCCATT TTTGGCTGTAGCAGCAGCAGTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGAGATTCAGTTTGAAGCTGGACTTCACTTTTGCCTCTCTCTCCTGTGCTTGCCTCTTCCATTCCTGCTGCTAGGCTGTT GCAAATCAAAGAACTGCTCCTCAGTGGATGTTGCCTTTACTTCTAGGCCTGTACGGAAGTGTTACTTCTGCTCTAAAAGCTGCGGAATTCCTCGAGCACTGTTGGCCTACTATCAGCAGCAGCCACAGCAAAATTTGGTTTGGGATAGGTAGGTGTTATGTTAGGTCTGGTTTTTTGGCTGTAGCAGCAGCAGTGGAAGGGGCATGCAGAGGAGCAGGAGATTCAGTTTGAAGCTGGACTTCACTTTTGCCTCTCTCTCCTGTGCTTGCCTCTTCCATTCCTGCTGCTAGGCTGTTCTGTGGAAGTTTGCAGAGTTTATATTATGGGTTTAATCGTCCATGGCATCAGCATCAGCAGCGGTATGTCATGACAATGCGGCCGTGCGAGCTCCATGAGCTCGAATGCCATTGCAGTGGATTCAGGACAACGAAATGGACACTGTTTTTCGTTGGAAATTTGGGCGTATGCCGTTGTAAAATTCATGTTTCAGAGAAATGCCGCTACAAAATGTATCTATGAGCTTGAAGTTATCTCAAAGCTATCAGTAACACATTATTTGGTCAATTGTTCAGATCGGGGATTAGATGCGAAAGAACTACAGAGCGTGGAAAAAATGTATTAAAAAAGAGGGTTTTCTACAGTTAATTAAGCTGTATACCTTGACTAAATTTGTACTGTCACTTCCCAACTTAGAAAGCACTAATCAAGAAGAGTAGTATTGTCAACGACTCAGACTACCATAAAAATTAAAAGGAAAAATTAAAACTTTATTATTGAACTTAAAAAAGCCTGGGCGTGGAATGGCCAAAGGGAGGCAGATGGGAGGGGGGAATAAAAAAAAAAAACTCCCCCGGGGGGGGGGCCCCCGGGACCCCATTTCCCCCCAAAAAAGGGGGTTTAATTAACCCCCCGCGCCCCGGGGGCCCGTTTTTTTTTAAAAACCCCCGTGGAGGGGGGGAAAAACCCCGGGGGTTTCCCCCCAAATTTAATCCCCCCCTTGGGAACAACACTCCCCCCCTTTTTCCCCCGCGGGGGGGGG 2 0 5' arm Oryza_sativa mirnest 100 osa-MIR528 1e-44 -62 ...((((.(((((((((.(((((((((((((.(((.(((((..(((((..(((..(((((.....)))))...)))..)))))))))).))).))))))))))))).)))))))))))))... (-62)