mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTTGGAACGGAGGGAGTAT ACTCCCTCTGTTCTAGTCAT TACTCCCTCTGTTCTAGTCATTCTGGCTTTTCTACATACATGGTTCTTATACTATGTTACTATGTATCTGGACATAGCGTATATCTAGGTGCTTAGCAAGTCTATGTACTTAGAAAAACCAAAACGACTTACATTTTGGAACGGAGGGAGTAT 5 0 3' arm Saccharum_officinarum micropc MIR1122 0.0000000000006 tae-MIR1137 0.0001 -57.81 (((((((((((((((((((.((.(((.(((((((..(((((((.......(((.(((((....(((((((((.(((...))).))))))))).)))))))))))))))..))))))).))).)).))))........))))))))))))))). (-57.81)