mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTGAAGTCCAACA GAGCTCCTTGAAGTCCAACAAAAAATCTAACAGGTTAAATTGAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGCCCTATCTATTTATGATTTCAAACATATAGATAGGTTTGTGGGTTTGCATATGTCAGGAGCTTTATTTTACCCTTTGTTTGATCATTTTTTGGATTGAAGGGAGCTC 2 0 3' arm Solanum_lycopersicum micropc MIR159 2e-87 sly-MIR159 4e-91 -72.6 (((((((((..(((((((.(((..(((.(((((((.((((.(((((.(((((.((((.(..((((((.((((((((..((((........)))))))))))).))).)))..).)))).))))).))))).)))).)))...)))).)))..))).)))))))..))))))))) (-72.60)