mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTGAAGTCCAATA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAAGCTCCTGCTGGGTAGATCGAGCTGCTGAGCTATGAATCCCACAGCCCTATCACCATCTGTTATTTTGACGGGCCTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTACCTAATGTTGGATCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTC 2 0 3' arm Populus_tremula micropc MIR159 1e-66 ptc-MIR159b 7e-68 -71.72 (((((((((..(((((((.(((((.(((.(((((((((...(((((.(((((.((((....((.(((.((..(((.............)))..)).))).))....)))).))))).)))))..)))))))..)).))).))))).)))))))..))))))))) (-71.72)