mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAAAA TGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGTTCTAGCAAGGGTAAATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGTCCTATGTATCAGATTTTAGGGTTTGTTTCTGATGATGGTGATGATAGGCTTGTGGCTTGCATATTTCTGGACCTTCATTACCCCTTAAGTTTTTACCCCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 2 0 3' arm Citrus_sinensis micropc MIR159 5e-17 csi-MIR159 8e-96 -71.2 (((((((((((..((((((((((((((...((((((((..(((.(((.(.(.(((.((((.(..((((((.(((((.(((((....((((((.....))))))...)))))...))))).))))))..).)))).))).).).))).)))..)))))..)))...)))...)))))))))))..))))))))))) (-71.20)