mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTGGCTCGAGG GGAATGTTGTCTGGCTCGAGGTGCATGGAGAAACCTCTGATCGATCAGGTTTGATCTGTAGAGACTGATCTCGGACCAGGCTTCATTCC 4 0 3' arm Oryza_sativa micropc mir-166 3e-44 osa-MIR166d 2e-45 -35.8 ((((((..((((((..((((((.((.((((....))))((((((......)))))).........))))))))..))))))..)))))) (-35.80)