mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCT GAGTGATACTAAGAACACATG GGAGTGATACTAAGAACACATGTGATGGAATGAGTGCATTGATATGCTGTATGGTACAACTCTTTGATGCACATTTTTTTTCATTTGTGTTCTCAGGTCACCCCT 3 1 3' arm Centaurea_maculosa micropc MIR398 0.0004 aqc-MIR398a 0.000001 -38.9 ((.(((((.((.((((((((.((((..(((...((((((..(...(.((((...)))).)...)..))))))...)))..)))).)))))))).))))))).)). (-38.90)