mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCTT GGGGTGCCACCTAAGAACACAGG GAGGGGTGCCACCTAAGAACACAGGTCATCCCTTAACCAAATAGCTTGTGTTCTCAGGTCACCCCTT 1 2 3' arm Gossypium_hirsutum micropc MIR398 0.00005 gra-MIR398 2e-32 -32.1 ((((((((..((((.((((((((((..((...........))..)))))))))).)))))))))))) (-32.10)