mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTAAAAGTCAACGGTGTCAAA GGACACCGTGGACTTCTTATAA TTACTGTCTCCAGTTCGAAATGTTGGACACCGTGGACTTCTTATAACAAGTGTGACCCTTTATCTTAGTNAANAAATTTATGAAATATGTAAAACTATATATGTACATAAAAGTATATTTGACAATAAATCAAATAATATGAAAAAAAGATAATTACATAGATTTTTGGAATAAGACGGATGGTCAAACACGTCCTAAAAGTCAACGGTGTCAAATATTTTAAAACGGAGGGAGTACTACATAA TTACTGTCTCCAGTTCGAAATGTTGGACACCGTGGACTTCTTATAACAAGTGTGACCCTTTATCTTAGTNAANAAATTTATGAAATATGTAAAACTATATATGTACATAAAAGTATATTTGACAATAAATCAAATAATATGAAAAAAAGATAATTACATAGATTTTTGGAATAAGACGGATGGTCAAACACGTCCTAAAAGTCAACGGTGTCAAATATTTTAAAACGGAGGGAGTACTACATAAACAAATAAAACTAGGCATCTGATTAACACATTATCTATCAATCGATCGATCANTAGACGGGTATGCAGCAATCAGCATCAGCAGCATATGCGATGTGAATTGTGATGTATGCAACGGTGTATTTTTGCGGTAAATAAAGTGAAGCGGATATCTATCTATATAC 3 1 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR806 2e-35 osa-MIR806c 1e-33 -55.3 .((((.(((((..((.((((((((.((((((((.(((((.(((..((..((.(((((.(((.(((((...((..((((((((.((((((((............))))))......(((((((.......))))))).(((.........))).)).)))))))).))....))))).))).))))).))..))..)))))))).)))))))).)))))))).))..))))).))))........ (-55.3)