mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTGAAGTCCAATA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAAGCTCCTGCTGGGTAGATCGAGCTGCTGAGCTATGAATCCCACAGCCCTATCACCATCAGTCATTTTGATGGGCCTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTACCTAATGTTAGATCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTC 2 0 3' arm Populus_nigra micropc MIR159 4e-76 ptc-MIR159b 2e-77 -71.72 (((((((((..(((((((.(((((.((..(((((((((...(((((.(((((.((((....((.(((.(((((((.............))))))).))).))....)))).))))).)))))..)))))))..))..)).))))).)))))))..))))))))) (-71.72)