mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCACAGCTTTCTTGAAC TCAATAAAGCTGTGGGA TTCCACAGCTTTCTTGAACTGCAATTTCATGTAATCAGATCATTCATTCATTCATTGTCGTTGATGGTGTTGCATACATACGAGTACGTTGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGA 1 0 5' arm Gossypium_hirsutum micropc MIR396 0.0000004 ghr-MIR396b 7e-61 -43.5 ((((((((((((.((((((((((((...(((((.((.((....)).......(((..((...))..)))............)).))))).)))))))))))).)))))))))))) (-43.50)