mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTC GCTCCTTGAAGTCCAATAG GAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAGGATCTTGCTGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGCCCTATCTCATAATAAAGACTCTAGTCTTCTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTCATTACCTCTTATGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTC 3 0 3' arm Manihot_esculenta micropc MIR159 4e-45 rco-MIR159 2e-46 -85.8 (((((((((..(((((((..((((((((.((.((((((...(((((.(((((.((((.(..((((((.((((((.((.....(((((....)))))..)))))))).))))))..).)))).))))).)))))..)))))).....)).))))))))..)))))))..))))))))) (-85.80)