mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGACTGAAGGGAGCTCCCT AGAGCTTTCTTCAGTCCAAAC AGAGAGCTTTCTTCAGTCCAAACATGGGTGGCAGTAGGATTCAATTAGCTTCCGACTCATTCATCCAAATGCTGAGATGAGATGACGATGAACCCGGCCTTGATGACTAATGAACACTGTCTCAGTAACTGAGTGAATGATGCGGGAGACAAGTTGGATCTTAAGCTTCCTGTACTTGGACTGAAGGGAGCTCCCT 3 0 3' arm Ipomoea_nil micropc MIR159 1e-27 rco-MIR319a 5e-29 -85.7 ((.(((((..(((((((((((..(((((.(((..((((((((((((.(((((((..(((((((..((..(((((((((.((....((.......))...((.((.....)).))..)))))))))))..))..)))))))..)))))).).)))))))))))).))).)))))..)))))))))))..))))).)) (-85.70)