mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATGAGGAGAGGGACGAGGA CTCCGTCGCTTCCGAACTCAACCC TCCTCCGTCGCTTCCGAACTCAACCCCTCCACCGGCGTCGTCGTACCACCAATCGTCTCCGTCATCTAACGGTCGGCGGTGGAAACAGAAGCTGGTATGGGATGAGGAGAGGGACGAGGA 3 4 3' arm Brassica_rapa micropc 100 100 -48.8 (((((.(((.((((....((((.(((....((((((.((......(((((..(((...((((......)))).))).))))).....)).))))))..))).))))..)))))))))))) (-48.80)