mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCAAAGGAGAATTGCCCT GGTATATCTCCTTTGGCACG AGGGTATATCTCCTTTGGCACGGAGGCACGCAACCATCCGTAGGTATGTTAATGGATGGTGGCAAGCTGCTGGCTTGGAAGATGCAGCATAATAGCCGTGCGTGCCAAAGGAGAATTGCCCT 2 0 3' arm Panicum_virgatum micropc mir-399 0.000002 tae-MIR399 0.000000006 -66.6 ((((((..((((((((((((((.((((..((.(((((((((..........))))))))).))..(((((...((....))..)))))......))).).))))))))))))))..)))))) (-66.60)