mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGAGAGTGAGCACACACGGTG CTGTGCGTGCTCACTCTCTAT GGGTTTTGGAGGTCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGCTTTCTTAGCATGCAAGAGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGCCGTTCACCAT TTCTCTCTCTGTCAGCCATTTGATCTCTCTTTCTCTCTTTCTCCCTCATGTGTTATACTGTTCTCTCATATCTATCTTCTTTGAGGTAGTAATATACTTGAGCAAATTAAGCTGCTTAATTATTTGTGTATGATGATCAGCTGCTGATCCGGCCTCATTTCTTGCATATATGACCACAACCACATACATGCTTGTTCATTTTTTTTCACAAAGAAAGAGAACAGTTTAATTTAATTTCTTGGGGTTTTTGGATCAGTTAATTTGTCTTGAGAGGGGAAGAGATCTCTATGGGTTTTGGAGGTCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGCTTTCTTAGCATGCAAGAGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGCCGTTCACCATGCCCAATATGATTAATCTCCTTCTCTCAGTTGACAGTAATTT 2 0 5' arm Oryza_sativa mirnest mir-156 2e-43 osa-MIR156b 4e-59 -56.6 .(((...(((((.(((((((((((((((((((((.((((((....(((((((((((....).)))))))))))))))).))))))))))))).)))))))))).)))))).. (-56.6)