mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATTGAGCCGTGCCAATATCT ATGTTGGCTCGGCTCACTCAGA GATGTTGGCTCGGCTCACTCAGACGGCATTGGCGTGATGCAAAGCATGCATGCGTGCTTGCTACCTCACTTGTGTTTCTGATTGAGCCGTGCCAATATCT 3 0 3' arm Oryza_sativa micropc MIR171_1 2e-48 osa-MIR171e 1e-49 -53.6 (((((((((.(((((((.(((((.(((((....((((.((((.(((((....)))))))))....))))..)))))))))).))))))).))))))))). (-53.60)