mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAATAG TGGAGCTCCTTGAAGTCCAATAGAAGCTCCTGCTGGGTAGATCGAGCTGCTGAGCTATGAATCCCACAGCCCTATCACCATCTGTTATTTTGACGGGCCTGCGGCTTGCATATCTCAGGAGCTTTATTACCTAATGTTGGATCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA 3 0 3' arm Populus_tremula micropc MIR159 3e-67 ptc-MIR159b 3e-70 -74.32 (((((((((((..(((((((.(((((.(((.(((((((((...(((((.(((((.((((....((.(((.((..(((.............)))..)).))).))....)))).))))).)))))..)))))))..)).))).))))).)))))))..))))))))))) (-74.32)