mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTCACTCTCTATCTGTCAGC CTGACAGAAGAGAGTGAGCAC GGTTTTGGAGGTCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGCTTTCTTAGCATGCAAGAGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGCCGTTCACCA TTCTCTCTCTGTCAGCCATTTGATCTCTCTTTCTCTCTTTCTCCCTCATGTGTTATACTGTTCTCTCATATCTATCTTCTTTGAGGTAGTAATATACTTGAGCAAATTAAGCTGCTTAATTATTTGTGTATGATGATCAGCTGCTGATCCGGCCTCATTTCTTGCATATATGACCACAACCACATACATGCTTGTTCATTTTTTTTCACAAAGAAAGAGAACAGTTTAATTTAATTTCTTGGGGTTTTTGGATCAGTTAATTTGTCTTGAGAGGGGAAGAGATCTCTATGGGTTTTGGAGGTCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACACGGTGCTTTCTTAGCATGCAAGAGCCATGCTGGGAGCTGTGCGTGCTCACTCTCTATCTGTCAGCCGTTCACCATGCCCAATATGATTAATCTCCTTCTCTCAGTTGACAGTAATTT 0 2 3' arm Oryza_sativa mirnest mir-156 2e-43 osa-MIR156b 6e-58 -56.6 (((...(((((.(((((((((((((((((((((.((((((....(((((((((((....).)))))))))))))))).))))))))))))).)))))))))).)))))). (-56.6)