mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGTTCTCAGGTCACCCCT GAGTGACACTAAGAACACATA AGGAGTGACACTAAGAACACATATGGTGGAATTGCTCTTTTACATATATAAAAGGTGCAATGATATGTTGTACTGTACAAATATCCAATGCACATACTTTTGTTTGTAAAGTCTTGTCGGCAATCCGTATGTGTTCTCAGGTCACCCCT 2 1 3' arm Helianthus_petiolaris micropc 100 ath-MIR398c 0.0001 -54.1 (((.(((((.((.(((((((((((((....((((((.(((((((...((((((((((((..(((((.(((((...))))))))))...)))))...))))))).))))))).......))))))))))))))))))).))))))).))) (-54.10)